汕头综合保积区享有“免征、免税、保税、退税”政策，是对外开放程度最高、运作机制最便捷、政策最优惠的经济区域之一。汕头综合保税区享受综合保税区相关税收和外汇管理政策，具备“入区退税”政策功能，并适用《关于促进综合保税区高水平开放高质量发展的若干意见》提出的21条优惠便利政策措施和《中共海关总署委员会关于印发海关支持综合保税区发展措施的通知》提出的6条优惠措施。汕头已获批为跨境电商零售进出口试点城市，综合保税区内企业开展跨境电商网购保税进出口业务可以享受相关优惠政策。2020年6月18日，粤东首单跨境电商网购保税进口业务在汕头综合保税区落地。